
Новый метод анализа белковых взаимодействий поможет в десятки раз ускорить исследования в биохимии и биомедицине
Профессор университета Иннополис Ярослав Холодов изобрел сверхбыстрый алгоритм моделирования белковых взаимодействий, который может проводить вычисления параллельно. По словам ученого, это поможет отказаться от дорогостоящих лабораторных экспериментов и полностью использовать компьютерное моделирование. На разработку алгоритма ушло более двух лет, а использовать его можно для увеличения скорости разработки лекарств, он также поможет разобраться в процессах внутри любых живых организмов.
— Теперь можно провести исследование и изобрести лекарство в десятки и сотни раз быстрее, включая лекарства от ВИЧ, рака, да и вообще любых заболеваний, — рассказал «Известиям» Ярослав Холодов. — Алгоритм также позволяет анализировать действия вирусов или, например, что происходит внутри растений. Вообще изучение белок-белковых взаимодействий привлекает большое внимание научного мира.
На разработку нового метода ученых подтолкнула необходимость решения двух важных задач. Во-первых — найти возможность быстрее доставлять лекарство до больных клеток. Дело в том, что при лечении особенно опасных заболеваний лекарства воздействуют не только на больные клетки, но и на здоровые, что пагубно сказывается на организме. Например, при лечении раковых заболеваний химиотерапией страдают и здоровые органы. Лекарство при доставке в организм начинает взаимодействовать с белками — основным строительным материалом клетки. В живом организме в клетке происходят сотни тысяч белковых взаимодействий. Для того чтобы понять, как создать новое лекарство и доставить его до необходимых белков, ученые и изучают взаимодействия одного белка с другим и характер этих взаимодействий. В конечном счете это поможет найти лекарство без побочных действий от любой болезни, включая раковые заболевания. Для этих целей используются лабораторные исследования либо компьютерное моделирование. Но на сегодняшний день это дорогостоящие мероприятия, небольшие группы ученых зачастую просто не могут себе этого позволить. Поэтому изобретатели поставили перед собой вторую цель: увеличить скорость вычислений и при этом снизить затраты на исследования. Существующие сейчас программы не могут выполнять параллельное моделирование, они только могут проводить последовательный мониторинг конфигураций независимо друг от друга. Поэтому до сих пор исследование занимало несколько дней, что требовало больших мощностей суперкомпьютеров. А с помощью нового алгоритма такое же исследование займет до 15 минут. Кроме того, новый алгоритм благодаря параллельным вычислениям позволяет находить дополнительные взаимосвязанные функции взаимодействий разных белков.
Читайте еще:
В России появится перваясеть квантового интернета
Сначала опытный фрагментсвяжет несколько точек вТатарстане
Руководитель лаборатории «Структурная биоинформатика» университета ИТМО Юрий Порозов рассказал, что новый алгоритм позволит на порядки расширить область поиска взаимодействующих молекул и решить три взаимосвязанные задачи, которые сейчас стоят перед учеными: как расширить ландшафт, как ускорить перебор вариантов и как повысить точность предсказания. Он отметил, что алгоритм позволит приблизиться к изобретению лекарства от рака, кроме того, есть огромное количество не менее серьезных болезней, которые также требуют внимания.
— Если мы получаем прирост производительности в 10 раз, то это значит, что за такое же время можно охватить гораздо больше вариантов или, если примерный набор интересующих пар найден, бросить вычислительные мощности на повышение точности предсказания или на оптимизацию структур, — пояснил Юрий Порозов. — Должно сократиться время ответа на угрозы, исходящие от новых заболеваний, с возникновением которых человечество сталкивается всю свою историю. Иными словами, новые лекарства будут появляться быстрее. К слову, от гипертензивных состояний в мире умирает 48,6% каждый год и еще 13,2% — от ишемии миокарда, и разработка лекарств для лечения этих заболеваний не менее актуальна, чем развитие терапии онкозаболеваний.
Разработка метода проводилась международной командой специалистов из России, США и Франции. Воспользоваться алгоритмом сможет любой желающий: его добавят в онлайн-сервис для расчета белковых взаимодействий ClusPro, разработанный этой же командой ученых в 2003 году.
Komentarze
order tetracycline
http://bio-catalyst.com/ - buy trimox online
order floxin online
<a href=http://bio-catalyst.com/>roxithromycin capsules</a> minocycline generic
fastest delivery of cialis buying online
cialis without doctor prescription <a href=" https://edplsgeneric.com/# ">take cialis with or without food</a>
cialis money order https://edplsgeneric.com/ cheapest cialis web prices
<a href=https://edplsgeneric.com/#>daily use of cialis</a> tiujana cialis
the effects of cialis on women
cost of cialis 20mg tablets <a href=" http://cialisirt.com/# ">cialis 30 day sample</a>
cialis 20 image https://edplsgeneric.com/ cialis tolerance
<a href=https://edplsgeneric.com/#>daily use of cialis</a> cialis in canada
Dodaj komentarz | Głos Wschodu
You have got superb knowlwdge on this site. https://sexgamesx.net/
side effects for cialis
п»їcialis <a href=" https://edplsgeneric.com/# ">generic cialis coming out</a>
cialis samples request http://cialisirt.com/ when is the best time to take cialis
<a href=https://edplsgeneric.com/#>where to bay cialis (tadalafil) pills 80mg</a> cialis canada
how to get cialis samples
side effects of cialis <a href=" https://edplsgeneric.com/# ">lowest price cialis</a>
cialis price http://cialisirt.com/ cialis money order
<a href=https://edplsgeneric.com/#>cialis samples request</a> cialis free trial
expired cialis 3 years
cialis without a doctor's prescription <a href=" http://cialisirt.com/# ">cialis without a doctor prescription</a>
generic cialis at walgreens pharmacy https://edplsgeneric.com/ can you have multiple orgasms with cialis
<a href=http://cialisirt.com/#>generic cialis available</a> 30ml liquid cialis
Dodaj komentarz | Głos Wschodu
thank so considerably for your website it aids a great deal. https://ketogendiets.com/
cialis maximum dosage
daily use cialis cost <a href=" http://cialisirt.com/# ">cialis 100 mg lowest price</a>
cialis side effects https://edplsgeneric.com/ cialis vs viagra
<a href=https://edplsgeneric.com/#>cialis cost</a> cialis generic availability
Dodaj komentarz | Głos Wschodu
college admissions essay of mice and men essay essay on current events https://essaysitesreviews.com/
real cialis without a doctor's prescription
interactions for cialis <a href=" http://cialisirt.com/# ">walgreens price for cialis 20mg</a>
cialis money order http://cialisirt.com/ cialis online
<a href=http://cialisirt.com/#>side effects of cialis</a> coupons for cialis
Dodaj komentarz | Głos Wschodu
triple diamond free slots free slots video poker free vegas penny slots https://slotmachinesworld.com/
does cialis lower blood pressure
cialis online <a href=" https://edplsgeneric.com/# ">cialis dosages</a>
generic cialis available http://cialisirt.com/ cialis for daily use
<a href=http://cialisirt.com/#>what is cialis</a> cialis side effects
generic names for cialis and viagra
cialis generic availability <a href=" http://cialisirt.com/# ">how often to take 10mg cialis</a>
cialis coupon http://cialisirt.com/ 5 mg cialis coupon printable
<a href=https://edplsgeneric.com/#>normal dose cialis</a> п»їcialis
cialis 20mg
cialis cost <a href=" http://cialisirt.com/# ">how to get cialis samples</a>
generic cialis without prescription http://cialisirt.com/ show cialis working
<a href=http://cialisirt.com/#>when is the best time to take cialis</a> online cialis
Dodaj komentarz | Głos Wschodu
Lovely Web page, Carry on the wonderful work. Thanks! https://gaypridee.com/
cialis discount card
cialis without a doctor's prescription <a href=" http://cialisirt.com/# ">30 mg cialis what happens</a>
cialis generic http://cialisirt.com/ cialis for peyronie
<a href=http://cialisirt.com/#>cost of cialis 20mg tablets</a> cialis dosage 40 mg dangerous
lowest price cialis
coffee with cialis <a href=" https://edplsgeneric.com/# ">cialis vs levitra</a>
when is the best time to take cialis https://edplsgeneric.com/ herbal replacement for viagra/cialis/levitra...
<a href=https://edplsgeneric.com/#>low cost cialis</a> generic cialis no doctor's prescription
Dodaj komentarz | Głos Wschodu
How are you, neat website you've got there. https://sex4games.com/
Dodaj komentarz | Głos Wschodu
Very useful....look forth to returning. https://howtowriteessaytips.com/
Dodaj komentarz | Głos Wschodu
aristocrat slots free play liberty slots instant play top
dollar slots in vegas https://candylandslotmachine.com/
Dodaj komentarz | Głos Wschodu
free video slots deep dish western slots multiclass spell
slots 5e https://slotmachinegambler.com/
Dodaj komentarz | Głos Wschodu
You've terrific stuff in this article. https://onlinecasinohero.com/
Dodaj komentarz | Głos Wschodu
d&d spell slots calendar with time slots free buffalo slots https://slotmachineonlinegratis.org/
cialis before and after
generic cialis without prescription <a href=" https://edplsgeneric.com/# ">cialis prices 20mg</a>
how does cialis work https://edplsgeneric.com/ cialis 30 day sample
<a href=https://edplsgeneric.com/#>cialis coupon</a> free cialis medication for providers
free adult chat sites
plenty of fish dating site of free dating
<a href=http://freedatingsitesus.com/?>single chatting free </a>
Dodaj komentarz | Głos Wschodu
The material is really significant. https://ketogendiet.net/
Dodaj komentarz | Głos Wschodu
thank so considerably for your website it aids a lot. https://ketogenicdiets.net/
Dodaj komentarz | Głos Wschodu
Thanks a bunch! This a outstanding website! https://gay-buddies.com/
Dodaj komentarz | Głos Wschodu
triple seven slots my vegas slots cheat tool free slots casino games http://slotmachinescafe.com/
lasix side effects
lasix dosage https://lasixst.com/# lasix 40mg
lasix medication
tadalafil online
buy tadalafil: <a href=" https://tabsrxst.com/# ">tadalafil without a doctor's prescription</a> - tadalafil without a doctor's prescription
tadalafil 20mg for sale
generic tadalafil
tadalafil generic india: <a href=" https://tabsrxst.com/# ">tadalafil 20mg best price</a> - cialis pills
buy tadalafil
Dodaj komentarz | Głos Wschodu
Incredible....this is a handy web-site. https://vpn4torrents.com/
Dodaj komentarz | Głos Wschodu
add slots game girls borderlands map slots dragon slots https://slotmachinescasinos.com/
tadalafil without a doctor's prescription
buy ventolin without prescription: <a href=" http://ventolintop.com/# ">albuterol inhaler for sale</a> - can i buy ventolin over the counter uk
tadalafil 20mg
tadalafil pills
buy valtrex: <a href=" http://valtrex10.com/# ">generic valtrex for sale</a> - valtrex coupon canada
tadalafil pills
Dodaj komentarz | Głos Wschodu
Wow, attractive website. Thnx ... https://topessayswriter.com/
Dodaj komentarz | Głos Wschodu
gay dating site out personal customer service boomerang gay dating gay
tiny micro dick dating https://gaytgpost.com/
Dodaj komentarz | Głos Wschodu
local gay dating popular gay dating apps i have no
gay friends cuz everyone sees me as a potential dating
partner https://gaysugardaddydatingsites.com/
tadalafil 20mg best price
ventolin 100mcg price: <a href=" http://ventolintop.com/# ">ventolin uk</a> - ventolin in usa
tadalafil 20mg best price
Dodaj komentarz | Głos Wschodu
free games slots games slots bier haus slots https://2-free-slots.com/
Dodaj komentarz | Głos Wschodu
play free bonus slots real casino gambling slots double diamond slots free https://freeonlneslotmachine.com/
tadalafil online
how do i get propecia: <a href=" http://medrxst.com/# ">generic propecia</a> - propecia without a prescription
cialis pills
impotence pills
cheapest ed pills <a href=" https://edpillst.com/# ">erectile dysfunction medications</a> - mens ed pills
best ed pills non prescription
Dodaj komentarz | Głos Wschodu
Maintain the incredible work !! Lovin' it! https://criticalthinkinginstitute.com/
Dodaj komentarz | Głos Wschodu
Very helpful looking forward to visiting again. https://yoursuperessay.com/
men's ed pills
ed treatment pills <a href=" https://edpillst.com/# ">ed medication online</a> - ed pill
best ed pills at gnc
Dodaj komentarz | Głos Wschodu
You've the most effective online websites. https://casinogamesmachines.com/
reliable rx pharmacy
canada drugs online reviews <a href=" https://pharmfst.com/# ">ed drugs</a> - pharmacy home delivery
affordable pharmacy
Strony
Dodaj komentarz